Die Gründung erfolgte am 23. Juni 1993 durch eine Fusion des Genie-Vereins Basel, gegründet am 25. Juni 1887, und des Pontonier-Fahrvereins Breite-Basel, gegründet am 1. Juni 1882.
Auf Initiative zweier Basler Pontoniere hatten am 1. Oktober 1880 einige Wasserfahrer den „Rheinklub Basel“ gegründet. Im Jahre 1882 wurde sein Name in „Pontonierfahrverein Basel“ abgeändert. Dieser Verein bezog im April 1882 den Depotplatz unter der Wettsteinbrücke (Grossbasler Seite). Weil dem Pontonierfahrverein Basel nur Pontoniere angehörten, entschlossen sich vier Geniesoldaten am 15. Juni 1887, ihrerseits einen Verein mit dem Namen „Genie-Verein“ zu gründen. Auf Antrag der Pontoniere erfolgte am 8. Januar 1888 die Fusion beider Vereine. Der neue Verein nannte sich „ Genie-Verein“. (Nachzulesen im Basler Stadtbuch 1987 "108. Ausgabe" ab Seite 194.)
Das grosse Hochwasser des Rheins und der Birs vom 1. September 1881 verwüstete das heutige Lehenmatt- und Breitequartier. Als Dank für ihre tatkräftige Hilfeleistung erhielten die damals „freien Wasserfahrer“ von Herrn Rudolf Sarasin (Bandfabrikant in Basel und Besitzer der Arbeiterwohnungen am Lehenmattweg) 2 Weidlinge gespendet. Damit war die Voraussetzung für die Gründung eines Vereins von Wasserfahrern auf der Breite geschaffen. Per 1. Juni 1882 wurde der „Rheinclub Breite“ gegründet und der Name später in „Pontonier-Fahrverein Breite-Basel“ geändert. (Quelle 100 Jahr Pontonier-Fahrverein Breite-Basel).